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Biochimie, biotechnologies

Electrophorèse des isoenzymes de peroxydases, endopeptidases et transaminases

Ce QCM concerne un croisement entre le prunier (Prunus salicina) et l'abricotier (Prunus armeniaca) qui donne la néctarine (pluot). La réussite du croisement est suivie par les marqueurs isoenzymatiques du type 'peroxydases cathodiques' (POX) générés après électrophorèse
pluot, prunier, abricotier Le deuxième exemple porte sur les isoenzymes des transaminases (GOT) et endopeptidases (ENP) du palmier dattier, Phenix dactylifera L.

معلومات عن الهجين برقوق-مشمش:
يتعلق الأمر بفاكهة لذيذة جدًا ولكنها لا تزال نادرة في الأسواق. البرقوق-مشمش شجرة فاكهة هجينة ، ناتجة عن تهجين موجه حصل في الولايات المتحدة الأمريكية في الثمانينيات بين شجرة البرقوق ، والتي تمثل حوالي ثلاثة أرباع من تراثها الجيني ، وشجرة المشمش. بدلاً من أن تشبه البرقوق في مظهره الخارجي ، لفاكهة البرقوق-مشمش ذوق لذيذ وحلو وعطر للغاية. تزهر الشجيرة في الربيع ، وتُقطف ثمارها عندما تنضج من يونيو إلى أغسطس - سبتمبر حسب الصنف.

The pluot, which is also called the apricot-plum, is a very tasty fruit but still rare. It is a hybrid fruit tree, resulting from the cross made in the U.S.A in the 1980s between a plum tree, which represents approximately 3/4 of its genetic heritage, and an apricot tree. Rather resembling a plum in its external appearance, the pluot contains a delicious, sweet and very fragrant flesh. The tree flowers in spring, and its fruits are harvested when ripe from June to August-September depending on the variety.


- QCM SUR ELECTROPHORESE (RAPPELS)
- QCM SUR LES MARQUEURS ISOENZYMATIQUES ('PEROXYDASES CATHODIQUES DU PLUOT'
- QCM SUR LES MARQUEURS ISOENZYMATIQUES (GOT et ENP DU PALMIER DATTIER


PASSER LES TROIS QCM (durée: 35 min) avec CORRECTIONS

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QCM FORMATIF SUR L'ELECTROPHORESE ET LES MARQUEURS DE TYPE 'ISOENZYMES' (CAS DES PEROXYDASES)

VIDEO INTRODUCTIVE (avec QCM) SUR L'ELECTROPHORESE ET LA REVELATION DES MOLECULES SEPAREES


QCM SUR L'ELECTROPHORESE (RAPPELS) /7 points:
Remplir les cases vides avec les mots ou chiffres convenables (écrire en MAJUSCULES, respecter les ESPACES et attention aux fautes d'ORTHOGRAPHE)
- L'électrophorèse est une technique de séparation qui exploite le(s) critère(s) moléculaire(s) [.................] (choix des réponses: TAILLE; TAILLE + CHARGE ELECTRIQUE; SOLUBILITE)
- Dans ces conditions; convenables, elles seront chargées [.................] (choix des réponses: NEGATIVEMENT; POSITIVEMENT; NEUTRES) et migreront vers [............] (choix des réponses: ANODE; CATHODE)
- L'électrophorèse de fragment d'ADN exploite le(s) critère(s) moléculaire(s) [.......] (choix des réponses: TAILLE; TAILLE + CHARGE ELECTRIQUE; SOLUBILITE; FORME)
- L'électrophorèse d'ADN de plasmide intact exploite le(s) critère(s) moléculaire(s) [............] (choix des réponses: TAILLE; TAILLE + CHARGE ELECTRIQUE; TAILLE + FORME; FORME)
- En électrophorèse, les gels (d'agarose ou de polyacrylamide) les plus concentrés, sont convenables pour la séparation des molécules de taille [............] (choix des réponses: FAIBLE; ELEVEE)
..... FAIRE CE QCM AVEC LES CORRECTIONS


QCM FORMATIF SUR LES MARQUEURS DE TYPE 'ISOENZYMES' (CAS DES PEROXYDASES CATHODIQUES DU PRUNIER ET DE L'ABRICOTIER). ENONCE


Une population de jeunes plants issus d'un croisement entre le prunier (Prunus salicina) et l'abricotier (Prunus armeniaca) a été étudiée pour son polymorphisme enzymatique montré par le système 'peroxydases cathodiques' (POX).
Pour cela, les feuilles prélevées de jeunes plants sont broyées séparément dans 60 µl d'un tampon d'extraction composé de 0,01 M Tris-HCl (pH 7,15), 3 mM DTE et 5% sucrose. Les extraits sont soumis à une électrophorèse sur gel d'amidon 11%. Le tampon du gel est constitué de 0,01 M d'Histidine (PM Histidine = 155,2). Le tampon d'électrodes contient 0,135 M Tris (préparé à partir d'une solution de Tris 0,5 M) et 0,043 M d'acide citrique (préparé à partir d'une solution d'acide citrique 0,1 M). Le pH des deux tampons est ajusté à 7,0 à l'aide d'une solution 1 M d'acide citrique.

Après révélation, le Zymogramme des POX obtenu montre 3 phénotypes électrophorétiques appelés arbitrairement A, B et C (voir figure).
Le prunier et l'abricotier présentent respectivement les phénotypes B et C.

peroxydases prunier, abricotier, pluot

1 / Rappeler brièvement, le principe de l'analyse des isoenzymes par électrophorèse.
2 / Quelle peut être la nature des isoenzymes codées par le gènes gouvernant les peroxydases cathodiques. Faire un inventaire des génotypes correspondant à tous les phénotypes.
3 / Quel est l'intérêt du système enzymatique des 'peroxydases cathodique' dans
cette étude.
4 / Comparer brièvement les marqueurs isoenzymatiques et ceux basés sur la technique PCR comme la méthode RAPD.

QCM DE L'EXERCICE. A l'aide de l'énoncé de l'exercice ci-dessus, remplir les cases vides avec les mots ou chiffres convenables (écrire en MAJUSCULES, respecter les ESPACES et attention aux fautes d'ORTHOGRAPHE)/ 13 points
- Les peroxydases sont dites ici, CATHODIQUES, car elles migrent en électrophorèse vers le pôle [...............] (choix des réponses: NEGATIF; POSITIF)
- Dans cet exercice, le pI de ces peroxydases est [...................] à pH 7,0 (choix des réponses: EGAL; INFERIEUR; SUPERIEUR)
- Si elles ont un pI inférieur à 7,0, elles seraient chargées [...............] (choix des réponses: NEGATIVEMENT; POSITIVEMENT; NEUTRES) et migreraient vers [.....] (choix des réponses: +; -) et seraient dites [.........] (choix des réponses: ANODIQUES; CATHODIQUES)
rep("Question 1: Le principe de l'analyse des isoenzymes par électrophorèse est fondé sur la révélation des gels par [.................] (choix des réponses: BLEU DE COOMASSIE; SUBSTRATS; BROMURE D'ETHIDIUM; SONDE) après une électrophorèse dans des conditions [...........] (choix des réponses: DENATURANTES; NON DENATURANTES; STABLES)
rep("Question 2: Pour déterminer la nature de l'enzyme, on doit compter le [.................] par individu (choix des réponses: NOMBRE DE ZONES D'ACTIVITE; NOMBRE MAXIMUM DE BANDES). En effet, ce nombre est égal à [.............] avec n = nombre de sous-unités de l'enzyme (choix des réponses: n - 1; n + 1; n)
- De ce fait, les peroxydases cathodiques répondent à une structure [................] (choix des réponses: MONOMERIQUE; DIMERIQUE; TETRAMERIQUE)
- Les peroxydases cathodiques sont sous le contrôle de [........] allèles (choix des réponses: 2; 3; 4)
- Si les allèles sont notés F (fast: rapide,S (slow: lent) et M (medium: intermédiaire), le phénotype électrophorétique B du prunier sera [.............] (choix des réponses: FF; SS; FS, MM)
- La néctarine (pluot) de phénotype électrophorétique A, est un [..............] (choix des réponses: HOMOZYGOTE; HYBRIDE)
rep("Question 3: L'intérêt de l'utilisation du systéme peroxydases cathodiques est [............................] (choix des réponses: DETECTION PRECOCE D'HYBRIDES; CERTIFICATION DU PRUNIER; CERTIFICATION DE L'ABRICOTIER)
..... FAIRE CE QCM AVEC LES CORRECTIONS


QCM FORMATIF SUR LES MARQUEURS DE TYPE 'ISOENZYMES' (CAS DES TRANSAMINASES (GOT) ET DES ENDOPEPTIDASES (ENP) DU PALMIER DATTIER). ENONCE

Trois populations F1 de jeunes plants de palmier dattier, Phoenix dactylifera L., sont obtenues à partir de 3 lots de graines provenant des croisements suivants :

Lot de graines (population F1) Croisements
  Cultivar (femelle) Mâle Nombre de plants F1
1 X ? M-2 128
2 Aguellid (AGL) M-1 164
3 Iklane (IKL) Y ? 60

L'analyse par électrophorèse du polymorphisme enzymatique de la glutamate oxaloacétate transaminase (GOT) et des endopeptidases (ENP) a été réalisée à partir d'extraits enzymatiques de feuilles par électrophorèse sur gel de polyacrylamide utilisé comme support de migration. Cette analyse a permis d'obtenir 5 et 6 phénotypes électrophorétiques respectifs pour les deux enzymes. Deux loci GOT-2 et ENP sont ainsi mis en évidence. Les différents phénotypes obtenus (A-F) sont résumés dans les diagrammes ci dessous.

phénotypes Got palmier dattier


endopeptidases, Got

Les cultivars AGL et IKL (parents femelles) présentent, respectivement, des phénotypes E et D pour ENP et D et A pour GOT.
Les parents mâles M-1 et M-2 ont comme phénotypes respectifs A et B pour ENP et E et A pour GOT.
Les fréquences des phénotypes isoenzymatiques au niveau des trois populations de jeunes plants sont données dans le tableau ci-dessous.

palmier


1. Quelle peut être la nature des isoenzymes codées au niveau des loci GOT-2 et ENP.
2. Sur la base des 2 loci, faire un inventaire des génotypes dans les 3 populations.
3. Sachant que les allèles mis en jeu sont transmis selon la loi de Mendel, quels peuvent être les génotypes du parent femelle X de la population 1 et du parent mâle Y de la population 3.
..... FAIRE LE QCM DE L'EXERCICE AVEC LES CORRECTIONS


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LIENS UTILES

- Travaux Pratiques sur Electrophorèse et détection des isoenzymes chez le palmier dattier
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- isoenzymes. Loci, allèles
- Isozymes hétéromériques
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