|
Accueil
--- Préambule --- Cellule
--- Biochimie-Matériaux
--- Protéines --- Protéomique
--- Enzymes --- Biologie-moleculaire
& Génie génétique --- Visualisation-moléculaire-JMOL-Rastop
--- Biotechnologies-applications
--- Techniques ---
Techniques-videos ---
QCM-Exercices-Examens-Concours
--- Liens-utiles --- Transition
secondaire-supérieur -- Etudiants-Etudes
--- Annonces ---Takween
supports --- Newsletter
--- E-books --- Contact
|
|
|
Peptides,
البيبتيدات
(oligopeptides,
polypeptides)
|
|
Les peptides sont constitués d'un nombre déterminé d'acides aminés liés entre eux par des liaisons peptidiques. On parle de peptides pour les molécules de moins de 100 acides aminés.Les oligopeptides contiennent un nombre réduit d"acides aminés (deux à une dizaine). Les polypeptides sont formé de quelques dizaines à 100 acides aminés. On parle souvent de protéines lorsque le nombre d'acides aminés dépasse 100.
البيبتيدات
(Peptides) بإمكان الأحماض الأمينية أن ترتبط بعضها بالبعض بروابط كيميائية تساهمية تعرف بالروابط البيبتيدية (Liaisons peptidiques, CO-NH) أو روابط أميد (Liaisons amide) و تجمع مجموعة الكربوكسيل فوق الكاربون ألفا (α) من الحمض الأول مع مجموعة الأمين فوق الكاربون α من الحمض الثاني. Pour former des peptides ou des protéines, les acides aminés se lient les uns aux autres par des liaisons covalentes appelées liaisons peptidiques ou liaisons amides (acide + alcool), connectant le carboxyle porté par le carbone alpha du premier acide aminé avec le groupement amine fixé sur le carbone alpha du deuxième acide aminé. تسمى البيبتيدات التي تتكون من إثنين إلى بعض العشرات من الأحماض الأمينية بالبيبتيدات القليلة (Oligopeptides). و هي لا تنتج عن ترجمة أي ARNm (أنظر فقرة تعبير الخبر الوراثي). تسمى البيبتيدات وفق نوع و ترتيب الأحماض الأمينية، إذ تبدأ التسمية بالحمض الأميني الطرفي الذي يحتوي على مجموعة أمين طرفية حرة و يضاف المقطع 'إيل' (yl) في نهاية اسم كل حمض أميني ما عدا الحمض الأميني الأخير الذي يضم مجموعة الكربوكسيل. مثلا، لوسيل كليسيل سيستيين (Leu-Gly-Cys). Les peptides constitués de deux à quelques dizaines d'acides aminés sont appelés 'oligopeptides'. Ces derniers ne résultent pas de la traduction d'ARNm (ARN messager). Ainsi, on trouve des dipeptides (2 acides aminés), tétrapeptides (4 acides aminés) et ainsi de suite. L'écriture du nom d'un peptide commence par l'écriture, en ordre, des noms de tous les acides aminés qui le composent en ajoutant 'yl' après chaque nom et en commençant par l'acide aminé de l'extrêmité N-terminale libre, excepté le nom du dernier acide aminé. Exemple: Leu-Gly-Cys appelé Leucyl-glycyl-cystéine. عديد البيبتيد (Polypeptide) يتكون من حوالي 30 حتى 100 حمض أميني و هو ينتج عن ترجمة ل ARNm. أما البروتين (Protéine) فيحتوي على ما فوق 100 حمض أميني. يعد الأنسولين (Insuline)، هرمون خفض مستوى السكر في الدم و المتكون من 51 حمضا أمينيا، كعديد البيبتيد يتشكل من سلسلتين A و B ب 21 و 30 حمضا أمينيا، بالتتالي Les polypeptides d'environ 30-100 acides aminés. Ils résultent de la traduction d'ARNm. Les protéines contiennent plus de 100 acides aminés. L'insuline, hormone hypoglycémiante (le manque dans l'organisme donne le diabète), est un polypeptides constitué de 51 acides aminés, répartis sur deux chaînes, A et B avec 21 et 30 acides aminés, respectivement. كيف يحتسب pHi في البيبتيدات؟. Comment calculer le pHi des peptides لإحتساب
قيمة pHi
لبيبتيد معين، يجب التعرف أولا عن تركبته
في الأحماض الأمينية، ثم ترتيب كل مجموعاته
التأينية (مجموعة الأمين للطرف الأميني
و مجموعة الكربوكسيل للطرف الكربوكسيلي
زائد مجموعات R
المتأينة لكل الأحماض الأمينية) وفق الحموضة
التنازلية (ترتيب تصاعدي لقيم pK).
بعد هذا، نكتب معادلات التفكك انطلاقا
من أصغر pK.
قيمة pHi
للبيبتيد تساوي معدل قيمتي pK
للشكلين من الحمض الأميني اللذين يحيطا
الشكل ذو الشحنة الكهربائية المساوية
للصفر (A+).
لنعتبر بيبتيد P
المكون من ثمانية أحماض أمينية
(أنظر الرسم التالي). عند pH
= 1،
يظهر البيبتيد 5 مجموعات متأينة حاملة،
كلها، لبروتون H+،
إذ يأخد البيبتيد شكل P2+.
الشكل التأينيP2+2-
للبيبتيد
(يظهر مع pHi)
و يحيط به pk3
و pK2.
هكذا يكون pHi
هو معدل pK2
و pk3. Pour
calculer le pHi d'un peptide donné (ici un octapeptide), il
faut d'abord connaître sa composition en acides aminés.On
commenc à classer les groupements ionisables du peptides (Amine
terminal, carboxyl terminal, radicaux R des différents acides
aminés) par ordre décroissant de leur acidité
(= ordre croissant des valeurs des pK) et on écrit les équilibres
de dissociation en commençant par le pK le plus faible (groupements
se dissociant le premier). La valeur du pHi du peptide est la moyenne
des pK qui entourent la forme du peptide à charge électrique
nulle (P 2+, 2-, ici). Dans cet exemple, pHi = (pK2 + pK3)/2.
تطبيقات
لمفهوم pHi
في ترسب البروتينات كتقنية للفرز و التحليل
في البيوكيمياء إذا وضع بروتين ما في محلول ذو pH أصغر أو أكبر من pHi للبروتين، سيأخد شكل أيونين بشحنات كهربائية موجبة (+) و سالبة (-)، بالتتالي. في كلتا الحالتين، تتنافر إيونات البروتين فيما بينها، حيث يبقى البروتين ذائبا في المحلول المعين. في حالة تساوي pH المحلول و pHi للبروتين، يحدث تجاذب بين الأيونات، نظرا لاحتوائهم عن شحنات موجبة و سالبة، في نفس الوقت، و يقع ترسب البروتين (أنظر الرسم التالي). هناك عدة تطبيقات لترسب البروتين عند pHi في ميدان تصفية و عزل البروتينات، من بينها، عزل بروتين الكازين (caséine) من الحليب أثناء صناعة الأجبان. يتميز الحليب، بقيم pH تنحصر بين 6,4 و 6,8، تقريبا. يوجد بروتين الكازين ذو pHi 4,6، في شكل جزيئات سالبة الشحنة الكهربائية تتدافع بينها. عند ارتفاع حموضة الحليب إلى pHi 4,6، يترسب الكازين و ينفصل عن مصل الحليب (lactosérum). تسمى هذه العملية 'تخثر الحليب' (coagulation du lait). قد تنتج حموضة الحليب طبيعيا عن التخمر اللبني لسكر اللاكتوز (lactose) الموجود أصلا في الحليب. كما يمكن الحصول عنها بإضافة قطرات من حمض الخليك (acide acétique) أو الخل (vinaigre) للحليب المسخن تحت حرارة تقارب 40°C.
Détails (Ar) dans Livre + CD 'Sciences Naturelles-Biochimie' |
|
|
- |
|
| Peptides. oligopeptides, polypeptides | |