biochimie. Cours, techniques et applications en biotechnologies

LIPIDES ET ACIDES GRAS. VISUALISATION TRIDIMENSIONNELLE PAR JMOL

دراسة في البعد الثالت للذهنيات

Les acides gras constituent les bases des lipides provenant de différentes origines. Leur visualisation 3D à l'aide d'un programme, tel que JMOL, permet de se rendre compte de leur propriétés physico-chimiques à travers leurs structures.

Avant de passer à la visualisation tridimensionnelle (3D) de quelques lipides, On doit rappeler ces matériaux de base pour la cellule peuvent être distingués selon 3 grandes catégories:

1) Les Triglycerides qui sont formés d'un glycérol lié à 3 acides gras. Ils sont des esters (acide + alcool). Ils constituent la part importante des huiles végétales et animales. Ils constituent une réserve énergétique très importante pour plusieurs organismes vivants. D'ailleur,en industrie les acides gras sont synthétisés par hydrolyse des triglycérides
2) Les Phospholipides sont des esters de glycérol où deux fonctions alcools sont estérifiées par des acides gras et la troisième par un acide phosphorique. Ce dernier est un polyacide, la deuxième de ses fonctions acides est neutralisée par un alcool aminé (serine, éthanolamine, choline). La troisième et dernière fonction reste sous forme d'anion. Les phospholipides sont des constituants des membranes (membrane-QCM, Materiaux-exercice).

phospholipides

Phospholipide

Avertissement: la visualisation des molecules nécessite l'installation de java (http://www.java.com)


Instructions pour la visualisation des molécules :

1/ Choisir la molécules que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites

2/ Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger.

3/ Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la souris

3) Les stéroïdes sont formés d'un squelette de 4 cycles de carbones (noyau stérol). L'exemple le plus connu des stéroïdes est le Cholesterol qui existent uniquement chez les animaux.

4/ Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style --> combinaison ---> Boule et bâtons

5/ Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page   

6/ Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL: visiter la page: http://www.takween.com/StructureProteines/structures_preambule.html .

7/ Pour plus d'information sur JMOL, visiter: www.jmol.org

تنقسم الذهنيات إلى عدة أقسام من بينها 1) الجليسيريدات الثلاثية، 2) الذهنيات المفسفرة و 3) الستيرويدات الحلقية الشكل. تعد الأحماض الذهنية من الوحدات الأساسية في تركبة الذهنيات. و تنقسم الأحماض الذهنية إلى أحماض مشبعة و أحماض غير مشبعة. لقد بدأ الإهتمام أكثر بهذه الأخيرة نظرا لجودتها الغذائية و الصحية. هناك حمضين ضرورين و هما ينتميان إلى الأحماض الذهنية الغير المشبعة و ذات 18 ذرة كاربون و هما حامض اللينولييك و حامض اللينولينيك

Plus d'information sur le lien: materiaux lipides

Quels sont les AG essentiels ?. Ils sont au nombre de 2 et sont poly-insaturés avec 18 atomes de carbones:
- Acide linoléique (= C18:2w6, deux doubles liaisonss dont une sur le carbone 6 et l'autre sur le C9 par rapport au CH3 terminal) se trouve dans l'huile de tournesol, de soja, de maïs,..
- Acide linolénique (= C18:3w3, trois doubles liaisonss dont une sur le carbone 3 et les deux autres sur le C6 et C9 par rapport au CH3 terminal) se trouve dans l'huile de colza du lin, de soja et dans les poissons.

Les acides gras naturels, constituants des lipides, possèdent une chaîne carbonnée de 4 à 28 atome de carbone (nombre pair en général). La nouvelle dénomination pour les AG poly-insaturés est basée sur la place de la première double liaison par rapport au CH3 terminal (en oméga (w)).

Pour rappel, il existe des enzymes appelées 'désaturases' qui permettent d'introduire des doubles liaisons dans les AG des lipides.

Choisir un composant lipidique pour le sisualiser dans la fenêtre JMOL à gauche.

Molecule 1:
Acide Gras saturé, C16:0. Huile de palme et graisses
Molecule 2:
Acide gras monoinsature, C18:1W9. 85% de l'huile d'olive
Molecule 3:
Acide Gras poly-insaturé, C18:2W6, A.G essentiel
Molecule 4:
Acide Gras poly-insaturé, C18:3W3, A.G essentiel
Molecule 5:
Acide Gras poly-insaturé, C20:4W6, dans les graisses animales uniquement
Molecule 6:
Phospholipide: stearyl-oleyl-phosphatidylcholine
Molecule 7:
Lipide steroide C27
Molecule 8:
Lipide steroide, C19. Hormone

Javascript generated by a java program (Jmol_Web_Page_Maker) on 9 sept. 2007. Original page composed by J. Gutow 7/2006.


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Lipides, acides gras. Structure moleculaire JMOL