Biochimie et biotechnologies

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Molécules et enzymes de la glycolyse. Visualisation 3D par JMOL

جزيئات هدم الكليكوز. معاينة في البعد الثالث

La glycolyse prend lieu dans le cytoplasme de la cellule et transforme le glucose en acides pyruvique. Il y'a des étapes consommatrices d'énergie (ATP) (activation du glucose par phosphorylation) et des étapes libératrices d'ATP). La visualisation en 3D par JMOL des molécules et enzymes de la glycolyse permet de contribuer à la compréhension de la production de l'énergie par la cellule.


 ما هي أهم مراحل انحلال الكليكوز داخل الجبلة الشفافة  و ظهور حمض البيروفيك (Acide pyruvique). ؟

-         تنشيط الكليكوز في شكل فروكتوز 1، 6- ثنائي الفوسفاط و الذي سينشطر إلى جزيئين من سكر ثلاثي الكاربون مفسفر.

-         أكسدة جزيئا السكر ثلاثي الكاربون المفسفر إلى جزيئين من حمض البيروفيك. و تستعمل الطاقة المحررة من هذه الأكسدة في فسفرة ADP إلى ATP. تفاعل اكسدة اختزال (Oxydoréduction) هو عبارة عن إزالة الهيدروجين (Déshydrogénation)، و يتطلب مستقبل للهيدروجين و هو NAD+ (Nicotinamide Adénine Dinucléotide) الذي يختزل في صفة NADH  (+ H+) و الذي يعتبر كطاقة اختزالية للخلية (Pouvoir réducteur)، بينما يتأكسد سكر ثلاثي الكربون (يفرغ من 2 H+ و 2 e- ).

Avertissement: la visualisation des molecules par JMOL nécessite l'installation de java (http://www.java.com). Voir ci dessous

Molécules de la glycolyse dans les programmes de l'enseignement secondaire


Eboooooooooook

 

Choisir une Molecule: إختر جزيئ معين من بين الائحة

Instructions pour la visualisation des molécules par JMOL تعليمات الاستعمال:

1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites اختر الجزيئ المراد معاينته 

2. Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger. تحريك-دوران الجزيئ يتم بالضغط  مرتين مع استمرار الضغط  فوق الصورة مع تحريك الفأرة

3. Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la sourisتقريب و إبعاد الصورة يتم بالضغط المتواصل على زر شيفت يمين لائحة المفاتح مع تحريك الفأرة

4. Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style -->combinaison--->bâtons.
للمعاينة تحت لوالب ألفا و صفائح بيتا، يجب إتباع نقر يمين الفأرة و اختيار -->style-->Combinaison-->Cartoon

5. Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page  عند وضع الفأرة فوق درة معينة من الجزيئ يظهر اسمها و رقمها

6. Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL: visiter la page: http://www.takween.com/StructureProteines/structures_preambule.html

7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter: www.jmol.org

 


Glycolyse - molécules. Voir visualisation  JMOL

JMOL, Rastop:معاينة جميع الجزيئات ب -

Jmol, Rastop


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Glycolyse - molécules. Visualisation JMOL