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Molécules du cycle de Krebs. Visualisation tridimensionnelle
جزيئات حلقة كريبس. معاينة في البعد الثالث
Après décarboxylation du pyruvate en acétate (intervention de la pyruvate déshydrogénase, coenzyme A et NAD+), le cycle de Krebs, se déroulant dans la matrice des mitochondries, permet la destruction de l'acétate (véhiculé sous forme d'acétyl-coA), la production CO2 et production d'une molécule d'ATP et un pouvoir réducteur constitué de 3 molécules de NADH et 1 FADH2. La visualisation 3D par JMOL des molécules (4C-6C) et des enzymes du cycle de Krebs, contribue à la compréhension des phénomènes de production d'énergie dans la cellule.
يتجلى
دور حلقة كريبس (في ماتريس الميتوكندري)
في خلق جزيئات وسيطة لإنتاج ATP
في المراحل اللاحقة من التنفس. المرحلة
الأولى لحلقة كريبس تكمن في نقل الأستيل
(شكل C2)
فوق حمض الأكسالوأستات (Acide
oxaloacétique)
ذو 4 ذرات من الكاربون ليعطي حمض السيتريك
(شكل C6).
أما المرحلة الأخيرة، فتنتج من جديد حمض
الأكسالوأستات ليتفاعل من جديد مع الأستيل
و يبدأ دورة أخرى (أنظر الرسم التالي).
ينتج
عن دورة كريبس الهدم الكلي للأستيل المرتبط
سابقا بالأستيل كوأنزيمA
مع
تعويض لحمض الأكسالوأستات الضروري لإعادة
دورة جديدة. تتميز كل دورة كريبس بنتيجتين:
-
فصم
الكاربون و تحرير ثاني أكسيد الكربون CO2.
-
إزالة
الهيدروجين عن طريق اختزال المستقبلات
و FAD+
NAD+،
إذ
تصبحا بالتتالي،
NADH, H+
و FADH2.
-
تخليق
جزيئة
ATP(أو
GTP،
عند الحيوانات).
Molécules du cycle de Krebs dans les programmes de l'enseignement secondaire
Sélectionner une molécule du cycle de Krebs et voir les instructions JMOL ci dessous: إختر جزيئ معين من بين الائحة
Instructions pour la visualisation des molécules par JMOL:
1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites
Avertissement: la visualisation des molecules par JMOL nécessite l'installation de java (http://www.java.com). Voir ci dessous
2.
Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image
et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris
tout en la faisant bouger.
3. Effectuer
un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift
(Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la souris
4. Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style -->combinaison--->bâtons
للمعاينة تحت لوالب ألفا و صفائح بيتا، يجب إتباع
clic droit -->style-->Combinaison-->Cartoon
5.
Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées
(type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du
bas de la page
6. Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle
des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL:
visiter la page: http://www.takween.com/StructureProteines/structures_preambule.html
7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter:
www.jmol.org
Javascript
generated by a java program (Jmol_Web_Page_Maker)
on 10 sept. 2007.
Original page composed by J.
Gutow 7/2006.
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