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Actine G
et ATP. Visualisation par JMOL
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L'actine est une protéine constituée d'un polypeptide de 375 acides aminés. Dans la cellule, elle existe sous deux formes; 1/ Actine G (Globulaire), monomérique et soluble en solution aqueuse et 2/ Actine F (Filamenteuse) qui est un polymère d'actine G.Le monomère d'actine G est associé à un nucléotide de type ATP ou ADP et un cation divalent comme le magnésium ou le calcium. En l'absence de ces deux cofacteurs, l'actine se dénature facilement. Avertissement: la visualisation des molecules par JMOL nécessite l'installation de java (http://www.java.com). Voir ci dessous --- Instructions-تعليمات |
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Sélection إنتقاء
Affichage إستظهار
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Coloration تلوين
Etude des liaisons دراسة الروابط
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1/ Etat
'contraint' de la myosine: en absence de tout nucléotide. La
myosine est intimement liée à l'actine
2/ Ouverture du 'site de fixation des nucléotides' en présence de ATP --> modification du site de fixation de l'actine (affaiblissement de la liaison actine-myosine) 3/ Hydrolyse de l'ATP après libération de la myosine, préalablement fixée à l'actine --> changement conformationnel dans la tête de myosine et positionnement nouveau pour la myosine --> Nouvelle fixation à l'actine; 4/ Départ du Pi du site des nucléotides et acquisition d'un deuxième changement conformationnel dans la tête.
La polymérisation de l'actine globulaire (Actine G) en actine filamenteuse (Actine F) est précédée par la fixation de l'ATP sur l'actine (activation). Une fois les filaments sont formés, il y'a hydrolyse de l'ATP en ADP. Détails dans le livre 'des Sciences naturelles aux sciences des molécules et biochimie' 1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites اختر الجزيئ المراد معاينته 2. Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger. تحريك-دوران الجزيئ يتم بالضغط مرتين مع استمرار الضغط فوق الصورة مع تحريك الفأرة 3. Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la sourisتقريب و إبعاد الصورة يتم بالضغط المتواصل على زر شيفت يمين لائحة المفاتح مع تحريك الفأرة 4.
Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre
souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation.
Ex: style -->combinaison--->bâtons. 5. Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page عند وضع الفأرة فوق درة معينة من الجزيئ يظهر اسمها و رقمها 6.
Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle
des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur
JMOL: visiter la page: http://www.takween.com/molecules-structure-3D/structures_preambule.html
7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter: www.jmol.org Javascript generated by a java program (Jmol_Web_Page_Maker) on 10 sept. 2007. Original page composed by J. Gutow 7/2006 |
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| Actine G - ATP. Structure par JMOL | ||