takween logo

Takween (formation) est dédié à la Biochimie et aux Biotechnologies. Si les biotechnologies classiques (culture des tissus et des cellules,..) n'exigeaient pas de connaissances approfondies en Biochimie et en Biologie moléculaire, les biotechnologies modernes, basées sur le DNA recombiné, nécessitent un acquis préalable en Biochimie des protéines, des enzymes et des acides nucléiques. Bref ceci nécessite une vraie formation et c'est ce que le site Takween espère donner à travers des cours, des exercices, des QCM... couvrant quatre sections; 'CELLULE ET LES MATERIAUX BIOCHIMIQUES DE BASE', 'TECHNIQUES BIOCHIMIQUES', 'PROTEINES. STRUCTURE ET FONCTION' et 'BIOLOGIE MOLECULAIRE'. Des liens permettent de visiter d'autres sites

ACIDES NUCLEIQUES. VISUALISATION TRIDIMENSIONNELLE

دراسة في البعد الثالث للأحماض النووية

Les nucleotides constituent les bases des acides nucleiques, dont le DNA (acides désoxyribonucleique). Leur visualisation 3D à l'aide d'un programme, tel que JMOL, permet de se rendre compte de leur propriétés physico-chimiques à travers leurs structures.

Avertissement: la visualisation des molecules nécessite l'installation de java (http://www.java.com). Voir ci dessous

Avant de passer à la visualisation tridimensionnelle (3D) des acides nucléiques par JMOL, on doit rappeler que ceux ci sont constitués de nucléotides, formés, eux même, d'une des 5 bases azotées (A, T, C, G et U), d'un sucre à 5 carbones ou pentose (ribose ou désoxyribose) et phosphate (sous forme triphosphate (nucléotide libre) ou monophosphate (nucléotide incorporé).

BASES AZOTES. CONSTITUANTS DES ACIDES NUCLEIQUES , DNA,..

Les bases azotées sont de 2 types différents; 1) les bases puriques sui sont l'Adénine (A) et la Guanine (G) et 2) les bases pyrimidiques qui sont la thymine (T), la Cytosine (C) et l'Uracile (U). Selon leur composition en nucléotides, les Acides nucléiques sont de deux types; 1) l'Acide Déoxyribonucléiques (ADN, DNA) contient les nucléotides à bases A, C, G et T et un sucre sous forme désoxyribose, 2) l'Acide Ribonucléique (ARN, RNA) constitué de nucléotides à base des bases A, C, G et U et du ribose comme sucre (Figure ci contre).

قبل الانتقال إلى دراسة الأحماض النووية في البعد الثالث، يجب التذكير أن هذه الجزيئات تتكون من النيكليوتيدات التي تتشكل نفسها من واحدة  من خمسة قواعد آزوتية و سكر من خمس  كربونات (ريبوز أو ريبوز ناقص الأكسيجين) و الفوسفات. القواعد الأزوتية تنقسم إلى قواعد من نوع بورين و أخرى من نوع بيريميدين. أما الأحماض النووية فهي صنفين: 1. الحامض النووي الريبوزي ناقص الأكسيجين، 2. الحامض النووي الريبوزي . انظر الجدول.

QCM sur acides nucléiques


Choisir une Molecule:


1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites
2. Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger.

3.Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la souris
4. P
our avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style -->combinaison--->bâtons
5. Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page
6. Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL: visiter la page:
http://takween.com/StructureProteines/structures_preambule.html
7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter:
www.jmol.org

Javascript generated by a java program (Jmol_Web_Page_Maker) on 10 sept. 2007.
Original page composed by J. Gutow 7/2006
.

Instructions pour la visualisation des molécules :
  1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites
  2. Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger.
  3. Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la souris
  4. Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style --> combinaison---> Boule & bâtons
  5. Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page  
  6. Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL: visiter la page: http://takween.com/StructureProteines/structures_preambule.html .
  7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter: www.jmol.org
,

Membre de Click-FR®, Réseau francophone Paie-Par-Click
Acides nucleiques et DNA. Visualisation 3D par JMOL