Biochimie et biotechnologies

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Structures tridimensionnelles de l'ATP (Adénosine triphosphate) et les acides nucléiques (ARN et ADN)
البنية الثلاثية البعد للأدنوزين ثلاثي الفوسفاط و الحمض النووي الريبوزي و الحمض النووي الريبوزي ناقص الأكسيجين. مقارنة  

Découverte en 1929 par Karl Lohmann, L'Adénosine 5'-triphosphate (ATP) est un ribonucléotide (constituant des ARN) utilisé par la cellule comme coenzyme et réserve d'énergie sous forme chimique. Le stock en ATP chez un organisme vivant est sous recyclage continu.

ATP et ARN


Le corps humain contient une quantité d'environ 250 g d'ATP qu'il renouvelle chaque jour
.

La contraction et la relaxation des muscules nécessitent de l'ATP qui intervient à trois niveaux lors de la contraction:

- Liaison de l'ATP à la myosine, nécessaire à la dissociation des têtes de myosine du filament d'actine ;

- Hydrolyse de l'ATP qui fournit l'énergie nécessaire au mouvement induit par la rotation des têtes de myosine ;

- Hydrolyse de l'ATP au niveau de la pompe calcium-ATPase qui permet la relaxation par recyclage du calcium.

Afin de maintenir une activité musculaire, les molécules d'ATP doivent être fournies par le métabolisme aussitôt qu'elles sont dégradées par la contraction. Ceci s'effectue par trois voies métaboliques essentielles:

- Synthèse d'ATP par voie anaérobie alactique ou voie des phosphagènes (s'éffectue au début d’un exercice).

- Synthèse d'ATP par voie anaérobie lactique (glycolyse anaérobie) par dégradation du glycogène en acide pyruvique. cette voie entraîne la formation d'acide lactique dont l’accumulation gène la contraction musculaire

- Synthèse d'ATP par voie aérobie (glycolyse aérobie et dégradation des substrats glucidiques et lipidiques dans la mitochondrie en présence d'oxygène)


 تخزن الطاقة في الروابط الكيميائية للجزيئات التي توفرها المواد الغذائية. و يتعذر على الخلية استعمال هذه الطاقة مباشرة، إذ يجب أن تنطلق من مركب واحد، و هو الأدنوزين ثلاتي الفوسفاط، الذي يرمز له ب ..ATP..و الذي يتكون من عدة ذرات من بينها الفوسفور (باللون الأصفر) و الأكسيجين (باللون الأحمر) و الأزوت (باللون الأزرق)، كما يبينه الشكل التالي

أسإلة متعددة الإجابات

QCM sur ADN et ARN


QCM ATP et production d'énergie


sciences naturelles, matériaux biologiques de base


 

ATP

يعتبر جزيئ ...ATP... كنكليوتيد ثلاثي الفوسفاط يدمج في الحمض النووي الريبوزي  (ARN) في شكله الأحادي الفوسفاط (AMP) 

Ribonucléotide. AMP



تدمج النكليوتيدات في الأحماض النووية في شكل نكليوتيدات أحادية (Nucléotides monophosphate)



dATP (désoxyadénosine triphosphate, désoxynucléotide triphosphate)

dATP s'incorpore sous monophosphate (dAMP) dans l'ADN

يطالب الطلبة بإيجاد الفرق بين البنى الثلاثية البعد للأدنوزين  ثلاثي الفوسفاط و حمض نووي ريبوزي

Les étudiants sont appelés à retrouver les différences entre la structure de l'Adénosine triphosphate (ATP) et celle d'un ribonucléotide (ARN)


Instructions pour la visualisation des molécules par JMOL تعليمات الاستعمال:

1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites اختر الجزيئ المراد معاينته 

2. Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger. تحريك-دوران الجزيئ يتم بالضغط  مرتين مع استمرار الضغط  فوق الصورة مع تحريك الفأرة

3. Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la sourisتقريب و إبعاد الصورة يتم بالضغط المتواصل على زر شيفت يمين لائحة المفاتح مع تحريك الفأرة

4. Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style -->combinaison--->bâtons.
للمعاينة تحت لوالب ألفا و صفائح بيتا، يجب إتباع نقر يمين الفأرة و اختيار -->style-->Combinaison-->Cartoon

5. Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page  عند وضع الفأرة فوق درة معينة من الجزيئ يظهر اسمها و رقمها

6. Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL: visiter la page: http://www.takween.com/StructureProtéines/structures_Préambule.html

7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter: www.jmol.org


JMOL, Rastop:معاينة جميع الجزيئات ب -

Jmol, Rastop


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ATP-ARN. Comparaison des structure tridimensionnelles par JMOL