Biochimie et biotechnologies

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Structure tridimensionnelle de l'ADN (Acide Désoxyribonucléique)

L'ADN (acide désoxyribonucléique) est le support de l'information génétique. Il est rencontré dans les noyaux cellulaires et certains organites comme les mitochondries et les chloroplastes.

En 1953, deux jeunes chercheurs, James D. Watson (25 ans) et Francis H. Crick (37 ans), publiaient dans la revue 'nature' un article d'une seule page uniquement, mais qui allait jouer un rôle capital dans la génétique et la biologie moléculaire. Cet article qui leur a valu le prix Nobel de Médecine en 1962, décrivait la proposition de structure actuelle pour la molécule d'ADN (DNA) ou acide désoxyribonucléique. L'article comportait une seule figure illustrant la notion de double hélice anti-parallèle. Le génie de Watson et Crick a été de savoir synthétiser les différentes connaissances de l'époque, pour aboutir à une proposition de structure tridimensionnelle de l'ADN. Ils avaient exploité les règles de Chargaff; A/T = C/G = 1 et (A+G)/(T+C) = 1. La visualisation de la structure tridimensionnelle de l'ADN et des différents nucléotides par JMOL permet de se rendre compte de ces données. L'ADN peut être extrait et purifié à partir de plusieurs. Il est analysé par électrophorèse.

Avertissement: la visualisation des molecules par JMOL nécessite l'installation de java (http://www.java.com). Voir ci dessous --- Instructions-تعليمات


ADN.

ADN dans les programmes de l'enseignement secondaire

QCM sur l'ADN et les acides nucléiques


Chaînes سلسلات

 

Sélection إنتقاء

 

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Coloration تلوين

 

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Coloration تلوين

 

Les étudiants sont appelés à retrouver la succéssion des nuclétides qui composent la molécule d'ADN, mettre en évidence la complémentarité des bases azotées et les liaisons qui les unissent


ADN. Structure tridimensionnelle. Détails avec JMOL

Détails dans le livre 'des Sciences naturelles aux sciences des molécules et biochimie'


تكمن أهمية ADN بالخصوص في كونه يمثل العنصر الأساسي في تشكيل الصبغيات و إيواء المورثات التي تتحكم في صفات كل الكائنات الحية. 

 يتكون ADN من لولبين يلتفان الأحد فوق الآخر. أما ARN فيتشكل من طرف واحد، مع إمكانية ظهور أطراف ثنائية من خلال طي الجزيئ (أنظر الرسم التالي). بالإمكان كذلك معاينة جزيئا ADN و ARN في البعد الثالث باستعمال برنامج راستوب (Rastop) الذي خصصت لشرحه فقرة كاملة.

DNA, ARN

ما هي المكونات الكيميائية للأحماض النووية ؟

تتكون الأحماض النووية ADN  و ARN  من سلاسل من وحدات كيميائية تسمى بـالنكليوتيدات (Nucléotides)، ويتكون كل نكليوتيد من ثلاث مكونات رئيسية:

  سكر خماسي الكاربون (Pentose). و هو ريبوز ناقص الأوكسيجين (Désoxyribose) في ADN أو ريبوز في ARN.

DNA, RNA

-         فو سفاط

-         قاعدة آزوتية (Base azotée)، قد تكون في ADN واحدة من أربعة قواعد و هي الأدنين (Adenine)، التيمين (Thymine)، السيتوزين (Cytosine) و الكوانين (Guanine).  و يرمز لها ب A، T، C و G، على التوالي. أما في ARN فتحل القاعدة أوراسيل (Uracile, U) محل القاعدة T.

ترتبط القواعد الأزوتية بينها وفق تطابق واطسون و كريك (Watson et Crick)؛ أي A مع T أو A مع U، حسب ADN أو ARN، بالتتالي ثم  C مع G.

يتم تلاقي القواعد الآزوتية عبر رابطتين هيدروجين حينما يتعلق الأمر ب A مع T -أو A مع U في ARN-و 3 روابط هيدروجين في حالة C مع G. توجد معلومات إضافية حول الأحماض النووية في الفقرة المخصصة للخبر الوراثي.


Détails dans le livre 'des Sciences naturelles aux sciences des molécules et biochimie' (Ar + Fr)

Instructions pour la visualisation des molécules par JMOL تعليمات الاستعمال:

JMOL. atomes. Couleurs

1. Choisir la molécule que vous voulez visualiser en la selectionnant dans les liens à droites اختر الجزيئ المراد معاينته 

2. Effectuer la ROTATION de la molécule en en pointant sur l'image et en maintenant appuyé le côté gauche de la souris tout en la faisant bouger. تحريك-دوران الجزيئ يتم بالضغط  مرتين مع استمرار الضغط  فوق الصورة مع تحريك الفأرة

3. Effectuer un ZOOM sur la molecule en maintenant enfoncée la touche shift (Î) du clavier et en tirant en avant et en arrière la sourisتقريب و إبعاد الصورة يتم بالضغط المتواصل على زر شيفت يمين لائحة المفاتح مع تحريك الفأرة

4. Pour avoir plus d'information sur la molécule, faite un clic droit par votre souris sur l'image et choisir, entre autres, le STYLE de visualisation. Ex: style -->combinaison--->bâtons.
للمعاينة تحت لوالب ألفا و صفائح بيتا، يجب إتباع نقر يمين الفأرة و اختيار -->style-->Combinaison-->Cartoon

5. Lorsque vous cliquez sur un atome de la molécule ses coordonnées (type d'atome, N°,..) s'inscrivent automatiquement sur la barre du bas de la page  عند وضع الفأرة فوق درة معينة من الجزيئ يظهر اسمها و رقمها

6. Pour savoir plus sur les commandes de visualisation tridimensionnelle des molécules du programme RASMOL s'appliquant aussi sur JMOL: visiter la page: http://www.takween.com/molecules-structure-3D/structures_preambule.html

7. Pour plus d'information sur JMOL, visiter: www.jmol.org

Javascript generated by a java program (Jmol_Web_Page_Maker) on 10 sept. 2007. Original page composed by J. Gutow 7/2006


JMOL, Rastop:معاينة جميع الجزيئات ب


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Insuline. Visualisation JMOL